1.0.0
- Versión inicia

1.1.0
- Añadida compatibilidad reducida con PocketPC 2003
- Añadido botón STOP en avisos con opción de cerrar la aplicación.

1.1.1
- Reducida la frecuencia de los avisos sonoros
- Mejorada la compatibiidad con PocketPC 2003 en la detección de señal perdida

1.2.0
- Añadida nueva función ‘Utilizar rutinas para (versión de Windows CE)’ que permite seleccionar las rutinas y limitaciones de una versión de Windows distinta de la instalada en su dispositivo.
- Icono de conexión mostrado permanentemente en pantalla para que el usuario pueda, en todo momento, confirmar que el puerto se encuentra conectado y la antena encendida.
- Al pulsar sobre dicho icono puede desplazarse para ser colocado en una parte de la pantalla que no moleste al usuario
- Al pulsar doble clic sobre el icono, MerlinBlueEar se pone en primer plano.
- Añadida opción ‘Mostrar Icono flotante’ en la pestaña Apariencia para seleccionar si se desea mostrar o no el icono flotante
- Añadido botón ‘Centrar Icono’ para centrar el icono en pantalla
- Modificada la selección de color de avisos para añadir colores predeterminados y mejorar la definición de los colores personalizados
- El color de texto del aviso ahora cambiará automáticamente a blanco o negro en función de la luminosidad del color de fondo elegido por el usuario para garantizar la visibilidad del mensaje
- Mejor centrado de los mensajes en pantalla horizontal.
- Aumentado tiempo de permanencia de avisos de Señal Perdida y de Reconexión Automática para permitir mejor la lectura del mensaje al usuario
- Modificación del texto de Señal Perdida y de Reconexión Automática para permitir al usuario una más rápida comprensión del mensaje (solo en Castellano).
- Modificada pestaña apariencia para añadir un selector de color con colores predeterminados.

1.3.0
- Eliminada la restricción sobre la reconexión automática en versiones anteriores a Windows CE 5.0
- Eliminada la restricción sobre el apagado de la antena al pulsar el botón STOP del mensaje de aviso en versiones anteriores a Windows CE 5.0
- Uso restringido del icono de notificación para versiones anteriores a Windows CE 5.0
- Ampliación del tamaño de los botones de la notificación para mejor funcionalidad.
- Corregido error en Windows CE 4.2 cuando se pulsa botón Conectar con error en el puerto
- Búsqueda automática de ficheros de sonido en directorio de aplicación en caso de error con los definidos por el usuario o por el instalador.
- Modificación del texto de Señal Perdida y de Reconexión Automática para permitir al usuario una más rápida comprensión del mensaje (también en idioma inglés).
- Añadida comprobación inicial de la versión de Compact Framework para avisar de la necesidad de actualización.